Храм расположен в Иерусалиме у подножия Елеонской горы в Гефсимании рядом с древним Гефсиманским садом.
Снаружи вход в храм обозначен скромным порталом, от которого вниз к храму ведет каменная лестница. В самой пещере в ее восточной части расположена часовня, наподобие Часовни Гроба Господня. В ней под мраморной плитой скрываются остатки каменного древнего погребального ложа. Во время православного богослужения эта плита служит престолом для молящихся. Весь храм увешан разнообразными лампадами.